برخی، پرورش ماهی را راه حلی برای مشکل صید بی رویه می دانند. با این حال، استخر پرورش ماهی بی خطر نیست و می تواند با معرفی بیماری ها، آلاینده ها و گونه های مهاجم به اکوسیستم ها آسیب جدی وارد کنند. خسارت ناشی از مزارع پرورش بسته به نوع ماهی، نحوه پرورش و تغذیه، اندازه تولید و محل پرورش آن متفاوت است. به نقل از سازمان غذا و کشاورزی سازمان ملل متحد (FAO):
تقریباً 32 درصد از ذخایر ماهی جهان بیش از حد مورد بهره برداری، تخلیه یا بازیابی قرار می گیرند و نیاز به بازسازی فوری دارند.